Versionamento no .net Framework

Aparentemente a Microsoft tem dois esquemas de versionamento do .net framework. Um é lado a lado, quando há uma mudança da major version. O outro esquema é quando há uma substituição total de um framework, devido a correções de assemblies e lançamentos de novas features.

Por exemplo:

A versão 1 e 1.1 rodam ambas no runtime da 1.
As versões 2, 3 e 3.5 rodam todas no runtime da 2 (aqui a Microsoft fez uma cagada, porque deveria versionar a 3 como 2.5, já que é uma atualização da 2, e a 3.5 deveria continuar a manter a major version como 2, por exemplo 2.5.5, mas eles apressaram as coisas para distribuir junto com o finado windows vista)
E temos a versão 4 e 4.5 que rodam no runtime da 4. A substituição de alguns assemblies da versão 4 pelo instalador da 4.5 pode causar alguns conflitos, principalmente para aplicações que usam novas features exclusivas da 4.5 ou programadores de componentes.

Esses conflitos são citados e podem ser contornados conforme as dicas do Rick Strahl e do SCOTT HANSELMAN